日本京都大学Seishi Ogawa小组绘制出克隆造血中单核苷酸变异和拷贝数改变的联合图谱。相关论文日前在线发表于《自然—医学》。
研究人员表示，健康个体的克隆造血(CH)与血液系统恶性肿瘤(HM)和心血管疾病的发展有关。先前对CH的研究分析了单核苷酸变异和插入缺失(SNV/indel)或拷贝数改变(CNA)，但不能同时分析两者。
结合使用23个CH相关基因的靶向测序以及基于阵列的CNA检测血液来源的DNA，研究人员描绘了来自BioBank Japan队列的11234个没有HM的CH相关SNV/indel和CNA情况，包括672个有后续HM发展的个体，并研究了这些体细胞改变对HM和心血管疾病死亡率的影响，以及对血液学和心血管表型的影响。两种类型的CH相关病变的总数及其克隆大小与血细胞计数异常和HM死亡率呈正相关。CH相关的SNV/indel和CNA在同一个体中表现出统计学上显著的共同发生。
特别是，影响DNMT3A、TET2、JAK2和TP53的SNV/indel和CNA的共同发生导致这些基因的双等位基因改变，并与较高的HM死亡率相关。SNV/indel和CNA的同时发生也调节了心血管死亡率的风险。这些发现强调了在CH评估中同时检测SNV/indel和CNA的重要性。
