来源：中国科学报 发布时间：2021-08-17 09:18:01
德国马克斯—普朗克生物化学研究所Jrgen Cox小组开发出新方法MaxDIA，可实现基于文库和无文库的数据独立采集蛋白质组学。《自然—生物技术》日前在线发表了这项成果。
MaxDIA是一个软件平台，用于在MaxQuant软件环境中分析数据独立采集(DIA)蛋白质组学数据。使用光谱库，MaxDIA实现了深度蛋白质组覆盖，蛋白质定量的变异系数比其他软件要好得多。MaxDIA能够在不同水平进行准确的错误发现率(FDR)估计，包括使用全蛋白质组预测光谱库时。这是发现DIA的基础：无需文库和可靠的FDR控制即可对DIA样品进行无假设分析。
MaxDIA对片段数据进行三维或四维特征检测，并且匹配的评分通过机器学习对识别特征进行增强。MaxDIA的bootstrap DIA工作流程执行多轮匹配，可提高重新校准的质量和匹配库的严格性。将MaxDIA与BoxCar采集和俘获离子迁移谱仪这两项新技术相结合，可实现深度和准确的蛋白质组定量。
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