当前的农产品质量安全分段监管体制，迫切需要建立贯通产业链、打通上下游的全程监管机制。基于此，中央一直强调要强化农产品产地准出与市场准入衔接。合格证作为农产品生产者自主开具的质量合格证明，附有农产品产地、生产者、质量安全等信息，并随农产品一同流通，是衔接产地和市场的有效抓手。推行合格证，建立健全了生产主体名录，将监管重心从后端检测前移到生产过程指导和服务，促进了产管衔接。发展到当前，农产品质量安全管理已经到了必须要大力推进合格证制度的新阶段。
要看到，试行合格证制度不是把责任都推到了生产者身上，而是对现有监管手段的丰富和提升。合格证既是自我承诺、是自律，又是营销者与消费者对生产者的倒逼、是他律。现在各地都在力推合格证，但不要想着依靠一张合格证包打天下。相反，监测、监管、执法等手段一个不能少，一律不能弱化。合格证制度不是放松了监管，监管反而要更加严格，不仅要监管质量安全，还要监管合格证的真实性。
如何让带证上市的农产品“真合格”，是合格证制度推行的要害所在，也决定了合格证的成色和“含金量”。不能仅靠“一张纸保安全”。既要重点关注中小生产者在开具合格证上存在的问题和困难，帮助和指导他们合理选购投入品、按要求用药、完善生产记录等，让他们有信心有条件开具合格证。又要避免农户随意开具合格证，合格证试行要稳扎稳打，数量服从质量，杜绝瞎开、乱开情况的发生。
