银杏为落叶大乔木，胸径可达4米，幼树树皮近平滑，浅灰色，大树之皮灰褐色，不规则纵裂，粗糙；有长枝与生长缓慢的距状短枝。
幼年及壮年树冠圆锥形，老则广卵形；枝近轮生，斜上伸展（雌株的大枝常较雄株开展）；一年生的长枝淡褐黄色，二年生以上变为灰色，并有细纵裂纹；短枝密被叶痕，黑灰色，短枝上亦可长出长枝；冬芽黄褐色，常为卵圆形，先端钝尖。
叶互生，在长枝上辐射状散生，在短枝上3~5枚成簇生状，有细长的叶柄，扇形，两面淡绿色，无毛，有多数叉状并列细脉，在宽阔的顶缘多少具缺刻或2裂，宽5~8厘米，具多数叉状。在长枝上散生，在短枝上簇生。它的叶脉形式为“二歧状分叉叶脉”。在长枝上常2裂，基部宽楔形，柄长3~10（多为5~8）厘米，幼树及萌生枝上的叶常较而深裂（叶片长达13厘米，宽15厘米），有时裂片再分裂（这与较原始的化石种类之叶相似），叶在一年生长枝上螺旋状散生，在短枝上3~8叶呈簇生状，秋季落叶前变为黄色。
球花雌雄异株，单性，生于短枝顶端的鳞片状叶的腋内，呈簇生状。雄球花葇荑花序状，下垂，雄蕊排列疏松，具短梗，花药常2个，长椭圆形，药室纵裂，药隔不发；雌球花具长梗，梗端常分两叉，稀3~5叉或不分叉，每叉顶生一盘状珠座，胚珠着生其上，通常仅一个叉端的胚珠发育成种子，内媒传粉。它的雄花花粉萌发时仅产生两个有纤毛会游动的精子。
种子具长梗，下垂，常为椭圆形、长倒卵形、卵圆形或近圆球形，长2.5~3.5厘米，径为2厘米，假种皮骨质，白色，常具2（稀3）纵棱；内种皮膜质。种皮肉质，被白粉，外种皮肉质，熟时黄色或橙黄色，外被白粉，有臭叶；中处皮白色，骨质，具2~3条纵脊；内种皮膜质，淡红褐色；胚乳肉质，味甘略苦；子叶2枚，稀3枚，发芽时不出土，初生叶2~5片，宽条形，长约5毫米，宽约2毫米，先端微凹，第4或第5片起之后生叶扇形，先端具一深裂及不规则的波状缺刻，叶柄长0.9~2.5厘米；有主根。
银杏树为裸子植物中唯一的中型宽叶落叶乔木，可以长到25－40米高，胸径可达4米，幼树的树皮比较平滑，呈浅灰色，大树树皮呈灰褐色，表面有不规则纵裂，有长枝与生长缓慢的锯状短枝。有着较为消瘦的树冠，枝杈有些不规则。一年生枝为淡褐黄色，二年生枝粗短，暗灰色，有细纵裂纹。冬芽为黄褐色，多为卵圆形，先端钝尖。4月开花，10月成熟，
银杏叶子在种子植物中很特别，是裸子植物中唯一一种阔叶落叶乔木，叶子是扇形，呈二分裂或全缘，叶脉和叶子平行，无中脉。在一年生枝上，叶螺旋状散生，在短枝上3至8片叶呈簇生状。成年银杏的扇形叶片主要有全缘、二分裂或多裂形态，但银杏幼株的叶片多数为二分裂，间中是多裂，极少是不裂的。雄球花4至6枚，花药黄绿色，花粉球形。萌发时产生具两个纤毛的游动精子。雌球花有长梗，梗端分为二叉，少有3至5叉或不分叉。
银杏寿命长，中国有3000年以上的古树。适于生长在水热条件比较优越的亚热带季风区。土壤为黄壤或黄棕壤，pH值5～6。初期生长较慢。雌株一般20年左右开始结实，500年生的大树仍能正常结实。一般3月下旬至4月上旬萌动展叶，4月上旬至中旬开花，9月下旬至10月上旬种子成熟，10月下旬至11月落叶。
