2021年11月以来，奥密克戎（奥密克戎）变异株迅速取代以德尔塔（Delta）为主的多种“令人担心的变异株（VOC）”，成为主要流行变异株，给全球的疫情防控带来巨大挑战。
目前，奥密克戎主要有BA.1和BA.2两个亚变体，世卫组织报告曾指出， BA.2毒株更易传播。4月19日，济民可信官方发布消息称，为揭示奥密克戎BA.2变异株传染性增强的原因，寻找预防及治疗的更有效手段，中国科学院上海药物研究所徐华强/尹万超团队联合济民可信研究团队聚焦奥密克戎变异株刺突蛋白，开展系统的功能测定和机制研究。
研究发现，奥密克戎BA.2比BA.1结合受体血管紧张素转换酶2（ACE2）的能力增强2倍左右。同时，研究还指出，新冠中和抗体JMB2002对奥密克戎BA.2、BA.1变异株均有中和能力。该研究论文近期已在线刊登于预印本bioRxiv网站。
新研究揭示奥密克戎BA.2传染性更强的原因结合力检测显示，奥密克戎BA.2相比BA.1变异株刺突蛋白，结合受体ACE2的能力增强2倍左右；同时，热力学实验显示，BA.2相比BA.1变异株刺突蛋白，拥有更稳定的受体结合功能域（RBD），以及更为灵活的变异株刺突蛋白三聚体；从解析的BA.2刺突蛋白结合其受体ACE2的结构中，同样看到刺突蛋白三聚体内相邻RBD特异的相互作用，形成类似BA.1变异株刺突蛋白结构中的RBD二聚体（图1B-1C）。
另外，从解析的BA.2刺突蛋白结合其受体ACE2的结构，可以看到BA.2相比BA.1变异株刺突蛋白，更倾向于处于RBD打开的可以结合受体ACE2的构象，这些信息都解释了奥密克戎变异株BA.2比BA.1传染性增强的问题。
图1 A，2022年以来三种突变株新冠病毒感染占比变化图；B，奥密克戎 BA.2 相对原始型的突变位点展示；C，奥密克戎 BA.2突变株刺突蛋白三聚体结合受体3个ACE2的结构侧面展示；D，奥密克戎 BA.2突变株刺突蛋白三聚体结合抗体JMB2002的结构顶面展示；E，抗体JMB2002阻碍人ACE2蛋白结合突刺蛋白图示
综合BA.2和BA.1变异株刺突蛋白分别结合受体人源ACE2的结构，研究发现，刺突蛋白上只有不到10%的突变位于蛋白内部，其它突变都位于刺突蛋白表面（图1B），包括多类中和抗体结合的抗原表位。这从结构上解释了奥密克戎变异株BA.2和BA.1都可以抵抗大部分中和抗体的分子机制。
从突变数量看，BA.2与BA.1变异株刺突蛋白分别拥有31和37处点突变，而BA.2与BA.1变异株刺突蛋白相比，也有22处点突变差异。从刺突蛋白1273个氨基酸序列的整体看，奥密克戎变异株的突变率都在3%以内，刺突蛋白表面的大部分仍与原始株接近，因此以原始株为基础研发的初代疫苗和部分中和抗体，仍可以在一定程度上保护奥密克戎感染者。这从结构上了解释了初代疫苗引起的抗奥密克戎变异株的免疫保护机制，同时也为提倡尽快尽早进行第三针新冠疫苗全员接种提供了理论依据。
济民可信中和抗体JMB2002具有广谱抗新冠病毒的潜力本项研究还显示，济民可信邓俗俊团队自主开发的新型作用机制的中和抗体JMB2002，可以高亲和力结合BA.2变异株刺突蛋白，并抑制BA.2变异株病毒进入细胞复制，且抑制活性与BA.1变异毒株相当。
2022年2月，以“Structures of the 奥密克戎 Spike trimer with ACE2 and an anti-奥密克戎 antibody”为题在线发表于《Science》杂志的一篇研究论文显示，新冠中和抗体JMB2002具有广谱抗新冠病毒的分子机制。
在上述研究成果基础上，研究团队进一步攻克了BA.2变异株刺突蛋白与特异性治疗抗体JMB2002的结构（图1D）。通过结构比较，可以看到，JMB2002结合BA.2与BA.1变异株刺突蛋白相同的抗原表位，也是通过阻碍刺突蛋白结合其受体ACE2实现对BA.2变异株的抑制（图1E）。
济民可信称，这些数据进一步佐证了JMB2002抗体具有广谱抗新冠病毒的巨大潜力。
